编者按

粗粒化模型中的Gay-Berne 相互作用势

  • 毛英臣 ,
  • 张德鹏 ,
  • 刘佳慧 ,
  • 孙 甍 ,
  • 王诗佳
展开
  • 辽宁师范大学物理与电子技术学院,辽宁大连 116029
毛英臣(1977—),男,山东莱州人,博士,辽宁师范大学物理与电子技术学院副教授,主要从事理论物理的

收稿日期: 2015-12-05

  修回日期: 2016-02-25

  网络出版日期: 2016-10-20

基金资助

国家自然科学基金项目(11447019)、教育部高等学校力学课程教学研究项目(JZW-15-LX-18)资助

Gay-Berne interaction potential used in coarse-graining molecular simulation

  • MAO Yingchen ,
  • ZHANG Depeng ,
  • LIU Jiahui ,
  • SUN Meng ,
  • WANG Shijia
Expand
  • School of Physics and Electronic Technology,Liaoning Normal University,Dalian,Liaoning 116029,China

Received date: 2015-12-05

  Revised date: 2016-02-25

  Online published: 2016-10-20

摘要

合理描述非球形粗粒化粒子间的相互作用是提高粗粒化分子动力学模拟速度的关键.为此本文介绍了Gay-Berne势.将之应用于两种有机小分子体系,在合理选择构象集后,由遗传算法得到了粗粒化粒子的GB 参数,并通过对粗粒化模型和全原子模型得到的范德瓦耳斯相互作用的对比检验了GB 力场参数.最后,指出如何处理作用位点是粗粒化模型发展的一个关键问题.

本文引用格式

毛英臣 , 张德鹏 , 刘佳慧 , 孙 甍 , 王诗佳 . 粗粒化模型中的Gay-Berne 相互作用势[J]. 大学物理, 2016 , 35(10) : 20 -22 . DOI: 10.16854/j.cnki.1000-0712.2016.0142

Abstract

How to compute effectively the interactions of non-spherical coarse-graining particles is critical for the improvement of computational speed of the coarse-grained molecular simulation,so we introduce Gay-Berne potential in this paper,and carry out applications for two small organic molecular systems. We derive the GB parameters of coarse-graining particles with genetic algorithm based on the reasonable conformational set. Moreover,we make some tests about the GB parameters through making comparison with the results from coarse-grained model and all-atom model,respectively. Finally,we point out how to deal with the interaction site is an essential problem for the development of coarse-graining model.
文章导航

/